Die Arbeit der GesamtElternBeiräte teilt sich in schulartbezogene Ausschüsse auf. Jede Schule und jedes Förderzentrum ist mindestens in einem Ausschuss Mitglied, vertreten durch zwei Delegierte. Die Elternbeiräte können extra Vertreter für die Ausschüsse wählen, andernfalls sind die Schulelternsprecher*innen automatisch delegiert.
Zusätzlich zu den GEBs tagen themenbezogene Arbeitsgruppen und Arbeitskreise.